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癌癥長鏈非編碼RNA轉錄組測序

癌癥長鏈非編碼RNA(lncRNA)轉錄組測序(LncRNAseq)


ncRNA(long noncoding RNA)是長度超過200 nt 的長鏈非編碼RNA,通過與DNA、RNA 或蛋白質結合,在表觀遺傳、轉錄及轉錄后等水平調控基因表達,與人類癌癥發生發展有密切聯系。LncRNA-seq 主要分析研究細胞或組織在某個特定時期轉錄出的所有lncRNA和mRNA。


1.技術路線



 

2.技術參數

        ? 樣本要求:

               RNA樣品總量≥1.5ug

               RNA樣品濃度≥100 ng/ul

        ? 測序策略:HiSeq PE150

        ? 數據量:一般深度:12Gb clean data

        ? 高深度:24Gb clean data

        ? 項目周期:60個自然日。



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