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癌癥全基因組重測序

癌癥全基因組重測序(WGS)


全基因組測序(Whole Genome Sequencing, WGS)是利用高通量測序平臺對人類不同個體或群體進行全基因組測序,并在個體或群體水平上,全面挖掘DNA水平的遺傳變異,為篩選癌癥驅動基因,研究癌癥發病機理提供重要信息。

1.技術優勢:CNVSV檢測;病毒整合位點檢測;非編碼區突變檢測;有效數據覆蓋均一;測序周期短。

2.平臺優勢:HiSeq X Ten測序平臺支持。

3.技術路線:

 


4.技術參數:

         ? 樣本要求

    樣品類型:DNA樣品;

    樣品總量:≥1.0ug DNA(提取自新鮮及凍存樣本);

 ≥1.5ug DNA(提取自FFPE樣本);

    樣品濃度:≥20 ng/ul

         ? 捕獲平臺:Agilent SureSelect Kit

         ? 測序平臺:HiSeq X Ten

         ? 測序策略:HiSeq PE150

         ? 測序深度:腫瘤癌組織(50X),癌旁組織/血液樣本(30X),遺傳病(30~50X);

         ? 數據量:1.8 Tb

         ? 項目周期:48個自然日。



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