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數字PCR技術平臺介紹

背景介紹


數字PCR(Digital PCR-dPCR)技術是一種新的DNA檢測和絕對定量方法。與傳統定量PCR(qPCR)技術不同,數字PCR是將傳統PCR的指數倍信號轉換成線性的數字信號,通過特定的儀器讀值,并利用統計學方法來對PCR產物進行分析。

目前數字PCR技術包含微滴式和微孔式檢測平臺,原理都是將含有核酸分子的反應體系分成成千上萬個單分子體系后,將單分子模板進行PCR擴增和核酸拷貝數精確定量。


數字PCR的研究進展


美國哈佛大學醫學院Dana-Farber癌癥研究所的Adrian G. Sacher團隊開展了一項前瞻性驗證研究,旨在分析血漿微滴式PCR(Droplet Digital PCR , ddPCR)用于快速檢測肺癌患者中EGFR和KRAS基因突變,以及EGFR T790M耐藥突變的可行性。研究結果2016年4月7日在線發表于JAMA Oncology雜志。

其研究結果表明:液體活檢技術的報告獲取時長遠低于傳統組織活檢技術;液體活檢檢測結果與傳統的組織活檢一致性較高;液體活檢能更好地反應腫瘤組織中不同突變的類型;液體活檢取樣簡單,可以對患者進行實時監測,對患者治療后新發突變及時檢測。


數字PCR的應用


數字PCR的應用范圍主要包括高精度拷貝數變異檢測,稀有突變檢測以及二代測序結果的驗證。意義主要為:耐藥突變檢測、治療靶點突變檢測、疾病早篩以及藥效評估。


數字PCR的優勢


· 高靈敏度—數字PCR技術是目前靈敏度較高的突變檢測方法之一(如圖1所示)。


圖1. 幾種技術平臺檢測靈敏度的比較


· 精準—數字PCR技術可精確定量基因突變豐度,高精度檢測拷貝數變異。

· 無創—組織或者血液樣本均可進行檢測。對于無法獲取組織的患者,可通過無創外周血檢測精確判斷每名患者EGFR- T790M的突變狀況。便于通過數字PCR多次檢測來動態監測腫瘤的進展動態,及時發現疾病進展,調整靶向治療方案。

· 檢測全面—由于腫瘤異質性廣泛存在,利用數字PCR進行液態活檢能夠對腫瘤內的多個部位在多個時間點進行檢測,就有可能鑒定出突變導致的腫瘤異質性,從而為個體化治療提供重要線索。

· 檢測周期短—相對于組織活檢技術和NGS技術,數字PCR技術的檢測周期更短。


泛生子公司在數字PCR方面的戰略合作




2016年6月28日,北京泛生子基因科技有限公司攜手美國賽默飛世爾科技,共同簽署戰略合作協議,共建精準醫學聯合研發中心。


泛生子公司在數字PCR方面的產品


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